作为党的诞生地的大学，学校把大力弘扬“红船精神”与贯彻落实“创新创业”战略紧密结合，秉承“方正为人勤慎治学”校训，致力于培养具有创新精神、实践能力和社会责任感的高素质应用型、复合型人才。
2013年5月，学校成立创新教育中心和创业教育中心，2015年11月在原有两中心基础上成立了独立建制的创业学院，坚持“规划、孵化、文化”的教育理念，在推动双创教育改革的同时大力传承弘扬红船精神，立足地方资源优势，制定了《嘉兴学院关于深化创新创业教育改革的指导意见》《嘉兴学院大学生创新创业教育实施方案》等10余个创新创业教育文件，打造了“入门•激发—专业•深度—行动•实践”递进衔接的创新创业课程体系，建立多方协作联动机制，构建了融合实验、实习、实训三个环节和创意、创新、创业三个阶段为一体的“三实三创”实践体系，着力打造大学生思想引领、创新创业、素质拓展、责任担当的双创培育平台，形成了“精神引领、实践驱动、多元融合”的地方应用型高校双创教育模式，形成了“课训赛孵一体”的人才培养机制，激发学生内生动力，促进应用型人才培养质量的有效提升。
目前，在校学生100%接受创新创业教育，60%学生参加了创新创业训练，30%的学生参加“互联网 ”“挑战杯”等综合类竞赛，近3%的学生成长为创新创业实战人才。学生先后荣获“中国青年志愿服务金质奖章”、连续三届“浙江骄傲”等荣誉。学生注册企业397家，500万以上毕业企业达20家。学生选择在当地就业创业的人数由5年前的8%上升到目前的38.6%。
学校牵头成立了嘉兴市大学生创新创业联盟、嘉兴市高校青年创新创业教育中心，先后荣获“浙江省普通高校示范性创业学院”“浙江省电子商务实践基地”“浙江省大众创业万众创新示范基地”“国家级众创空间”等荣誉称号。2019年，学校成为“挑战杯”全国发起高校。2021年以来学生荣获“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛金奖、“创青春”中国青年创新创业大赛金奖、中国“互联网 ”大学生创新创业大赛金奖等全国类顶级赛事的金奖，学校创新创业教育的成效日益显现。（数据截止至2022年12月31日）。
